Solg™ E. coli Uracil-DNA Glycosylase
공기 중 DNA 오염으로 인한 위양성 문제해결
SolGent™ E. coli Uracil-DNA Glycosylase (UDG)는 uracil을 포함한 DNA의 deoxyribose sugar와 uracil 염기 사이의 N-glycosylic 결합을 가수분해하여 uracil을 제거하는 효소로, cross contamination이나 carry-over contamination을 방지하기 위한 방법 중 하나입니다. UDG를 적용한 PCR 반응에는 dTTP 대신 dUTP를 사용합니다. 단, proofreading 기능을 갖는 DNA polymerase (B-family DNA polymerase ; Pfu 계열) 및 PCR enhancing factor로 dUTPase가 혼합된 제품과 함께 사용할 수 없습니다. 또한 uracil을 포함한 single strand DNA와 double strand DNA는 가수분해하지만, RNA에는 작용하지 않습니다.
제품사양
제품응용
Removing of uracil-containing DNA , Elimination carry-over contamination in PCR, PCR diagnosis, Site-directed mutagenesis
실험데이터
UDG 활성 테스트 (타사제품과 비교)
반응 온도에 따른 UDG 활성 테스트
실험과정예시
주로 동일한 실험을 반복하거나 PCR을 이용한 임상진단과 같이 다량의 검체를 이용하여 PCR을 수행할 경우, 이전에 사용하였던 시료 (PCR product) 의 공기 중 오염으로 위양성을 초래할 수 있습니다. UDG system은 이러한 문제를 해결하기 위한 방법 중 하나로 cross contamination이나 carryover contamination에 의한 위양성을 최소화 할 수 있습니다. UDG System에서는 PCR에 사용되는 dNTP mixture 중 dTTP 대신 dUTP를 사용하여 PCR을 수행합니다. 이때 증폭된 PCR product는“T”염기 대신“U”염기가 삽입됩니다 (dU-DNA) (STEP 1). 이후 다음 PCR 수행 전, PCR mixture에 UDG를 처리 한 후 PCR을 수행합니다. 만약 이전의 PCR product (dU-DNA)에 의해 검체가 오염되어 있다면, UDG에 의해 이전 PCR product 내 Uracil 염기의 N-glycosylic 결합이 가수분해되어 오염된 DNA는 제거됩니다 (STEP 2).
제품형태 (Format)
Choi JJ, Kim CH,
et al., Peptide Nucleic Acid-Based Array for Detecting and Genotyping Human Papillomaviruses, Journal of Clinical Microbiology, 47 : 1785-1790, 2009
제품형태 (Format)
주문정보 (Ordering information)
Manual
SUG21-R10h_SolGent_Uracil-DNA_Glycosylase_개정일_20221201